Un éditeur d'équation a été spécialement conçu pour Jaxe, afin d'ajouter et de modifier facilement des équations. Cet éditeur utilise l'élément EQUAJAXE. Il fonctionne avec une zone de texte, où l'on entre une équation avec une syntaxe particulière, et l'image correspondant à l'équation s'affiche en temps réel au-dessus. Les images des équations sont enregistrées dans un dossier nommé equations_monfichier placé dans le dossier du fichier XML monfichier.xml. Il produira l'élément suivant : <EQUAJAXE image="equations_le-schema/equation1.png" texte="slash(a;b)/c"/> donnera . La syntaxe à utiliser est détaillée :  ici.

L'élément EQUATEX permet aux utilisateurs de créer des équations en tapant les formules en TeX (ou LaTeX*). Les formules sont compilées sur un serveur où latex est installé, via un script php. Le texte "\frac{1}{2}" fournira l'élément suivant <EQUATEX image="eq_tex_le-schema/equation1.png" texte="\frac{1}{2}"/> :